Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24CP53992 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms