RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.71■■■■□ 3.79
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MVB12A-201ENST00000317040 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
MVB12A-201ENST00000317040 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.3■■■□□ 2.76
MVB12A-201ENST00000317040 HRCP23327 699 aa32.29■■■□□ 2.76
MVB12A-201ENST00000317040 NACADO15069 1562 aa32■■■□□ 2.71
MVB12A-201ENST00000317040 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.99■■■□□ 2.71
MVB12A-201ENST00000317040 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.95■■■□□ 2.71
MVB12A-201ENST00000317040 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.95■■■□□ 2.71
MVB12A-201ENST00000317040 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
MVB12A-201ENST00000317040 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
MVB12A-201ENST00000317040 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.58■■■□□ 2.65
MVB12A-201ENST00000317040 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.39■■■□□ 2.62
MVB12A-201ENST00000317040 SCRIBQ14160 1630 aa31.25■■■□□ 2.59
MVB12A-201ENST00000317040 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
MVB12A-201ENST00000317040 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.18■■■□□ 2.58
MVB12A-201ENST00000317040 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
MVB12A-201ENST00000317040 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.05■■■□□ 2.56
MVB12A-201ENST00000317040 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.98■■■□□ 2.55
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
MVB12A-201ENST00000317040 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
MVB12A-201ENST00000317040 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.47■■■□□ 2.47
MVB12A-201ENST00000317040 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
MVB12A-201ENST00000317040 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.16■■■□□ 2.42
MVB12A-201ENST00000317040 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
MVB12A-201ENST00000317040 MYT1Q01538 1121 aa30.07■■■□□ 2.4
MVB12A-201ENST00000317040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.02■■■□□ 2.4
MVB12A-201ENST00000317040 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
MVB12A-201ENST00000317040 SMARCA4P51532 1647 aa29.9■■■□□ 2.38
MVB12A-201ENST00000317040 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.88■■■□□ 2.37
MVB12A-201ENST00000317040 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.87■■■□□ 2.37
MVB12A-201ENST00000317040 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MVB12A-201ENST00000317040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
MVB12A-201ENST00000317040 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.67■■■□□ 2.34
MVB12A-201ENST00000317040 SMARCA2P51531 1590 aa29.61■■■□□ 2.33
MVB12A-201ENST00000317040 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.6■■■□□ 2.33
MVB12A-201ENST00000317040 NCAPD3P42695 1498 aa29.58■■■□□ 2.33
MVB12A-201ENST00000317040 WIZO95785 1651 aa29.55■■■□□ 2.32
MVB12A-201ENST00000317040 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
MVB12A-201ENST00000317040 NEUROD1Q13562 356 aa29.45■■■□□ 2.3
MVB12A-201ENST00000317040 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
MVB12A-201ENST00000317040 HMGXB3Q12766 1538 aa29.42■■■□□ 2.3
MVB12A-201ENST00000317040 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.28■■■□□ 2.28
MVB12A-201ENST00000317040 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
MVB12A-201ENST00000317040 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
MVB12A-201ENST00000317040 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
MVB12A-201ENST00000317040 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
MVB12A-201ENST00000317040 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
MVB12A-201ENST00000317040 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.259e-6■■■■■ 50.1
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.95■■■□□ 2.23
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
MVB12A-201ENST00000317040 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.78■■■□□ 2.2
MVB12A-201ENST00000317040 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.76■■■□□ 2.19
MVB12A-201ENST00000317040 NESP48681 1621 aa28.76■■■□□ 2.19
MVB12A-201ENST00000317040 CEP162Q5TB80 1403 aa28.71■■■□□ 2.19
MVB12A-201ENST00000317040 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.69■■■□□ 2.18
MVB12A-201ENST00000317040 CFTRP13569 1480 aa28.67■■■□□ 2.18
MVB12A-201ENST00000317040 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.66■■■□□ 2.18
MVB12A-201ENST00000317040 EEA1Q15075 1411 aa28.65■■■□□ 2.18
MVB12A-201ENST00000317040 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.61■■■□□ 2.17
MVB12A-201ENST00000317040 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.51■■■□□ 2.15
MVB12A-201ENST00000317040 ERCC6Q03468 1493 aa28.44■■■□□ 2.14
MVB12A-201ENST00000317040 MIER1Q8N108 512 aa28.42■■■□□ 2.14
MVB12A-201ENST00000317040 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.42■■■□□ 2.14
MVB12A-201ENST00000317040 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC8Q09428 1581 aa28.38■■■□□ 2.13
MVB12A-201ENST00000317040 GOLGA3Q08378 1498 aa28.36■■■□□ 2.13
MVB12A-201ENST00000317040 PRDM2Q13029 1718 aa28.35■■■□□ 2.13
MVB12A-201ENST00000317040 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.35■■■□□ 2.13
MVB12A-201ENST00000317040 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.31■■■□□ 2.12
MVB12A-201ENST00000317040 SOGA1O94964 1423 aa28.29■■■□□ 2.12
MVB12A-201ENST00000317040 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.27■■■□□ 2.12
MVB12A-201ENST00000317040 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
MVB12A-201ENST00000317040 KIF21BO75037 1637 aa28.18■■■□□ 2.1
MVB12A-201ENST00000317040 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.16■■■□□ 2.1
MVB12A-201ENST00000317040 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
MVB12A-201ENST00000317040 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
MVB12A-201ENST00000317040 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
MVB12A-201ENST00000317040 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.06■■■□□ 2.08
MVB12A-201ENST00000317040 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.06■■■□□ 2.08
MVB12A-201ENST00000317040 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
MVB12A-201ENST00000317040 WDR62O43379 1518 aa28.04■■■□□ 2.08
MVB12A-201ENST00000317040 TOPBP1Q92547 1522 aa28.01■■■□□ 2.07
MVB12A-201ENST00000317040 CUX1P39880 1505 aa27.98■■■□□ 2.07
MVB12A-201ENST00000317040 CLIP1P30622 1438 aa27.98■■■□□ 2.07
MVB12A-201ENST00000317040 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.98■■■□□ 2.07
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MVB12A-201ENST00000317040 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.93■■■□□ 2.06
MVB12A-201ENST00000317040 CUX2O14529 1486 aa27.91■■■□□ 2.06
MVB12A-201ENST00000317040 SYNJ1O43426 1573 aa27.87■■■□□ 2.05
MVB12A-201ENST00000317040 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.86■■■□□ 2.05
MVB12A-201ENST00000317040 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MVB12A-201ENST00000317040 TOP2BQ02880 1626 aa27.83■■■□□ 2.05
MVB12A-201ENST00000317040 APLP2Q06481 763 aa27.82■■■□□ 2.04
MVB12A-201ENST00000317040 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MVB12A-201ENST00000317040 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.81■■■□□ 2.04
MVB12A-201ENST00000317040 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.79■■■□□ 2.04
MVB12A-201ENST00000317040 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.72■■■□□ 2.03
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