Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP1O75113 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms