RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508394.6

SMUG1-215, Transcript of single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SMUG1, Length 1,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMUG1-215	ENST00000508394	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		51.68	■■■■■ 5.86
SMUG1-215	ENST00000508394	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		45.65	■■■■■ 4.9
SMUG1-215	ENST00000508394	ABCC9	O60706	1549 aa		44.26	■■■■■ 4.68
SMUG1-215	ENST00000508394	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	43.18	■■■■■ 4.5
SMUG1-215	ENST00000508394	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SMUG1-215	ENST00000508394	NACAD	O15069	1562 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SMUG1-215	ENST00000508394	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		42.71	■■■■■ 4.43
SMUG1-215	ENST00000508394	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SMUG1-215	ENST00000508394	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SMUG1-215	ENST00000508394	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SMUG1-215	ENST00000508394	SCRIB	Q14160	1630 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SMUG1-215	ENST00000508394	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	41.49	■■■■■ 4.23
SMUG1-215	ENST00000508394	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SMUG1-215	ENST00000508394	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SMUG1-215	ENST00000508394	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
SMUG1-215	ENST00000508394	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SMUG1-215	ENST00000508394	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		40.07	■■■■■ 4
SMUG1-215	ENST00000508394	SMARCA4	P51532	1647 aa		40.02	■■■■■ 4
SMUG1-215	ENST00000508394	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		40.02	■■■■■ 4
SMUG1-215	ENST00000508394	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
SMUG1-215	ENST00000508394	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		39.91	■■■■□ 3.98
SMUG1-215	ENST00000508394	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	39.62	■■■■□ 3.93
SMUG1-215	ENST00000508394	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		39.62	■■■■□ 3.93
SMUG1-215	ENST00000508394	SMARCA2	P51531	1590 aa		39.57	■■■■□ 3.93
SMUG1-215	ENST00000508394	WIZ	O95785	1651 aa		39.55	■■■■□ 3.92
SMUG1-215	ENST00000508394	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		39.52	■■■■□ 3.92
SMUG1-215	ENST00000508394	NCAPD3	P42695	1498 aa		39.44	■■■■□ 3.9
SMUG1-215	ENST00000508394	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	39.35	■■■■□ 3.89
SMUG1-215	ENST00000508394	HMGXB3	Q12766	1538 aa		39.32	■■■■□ 3.89
SMUG1-215	ENST00000508394	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	39.22	■■■■□ 3.87
SMUG1-215	ENST00000508394	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	39.08	■■■■□ 3.85
SMUG1-215	ENST00000508394	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		38.64	■■■■□ 3.78
SMUG1-215	ENST00000508394	NES	P48681	1621 aa		38.48	■■■■□ 3.75
SMUG1-215	ENST00000508394	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		38.36	■■■■□ 3.73
SMUG1-215	ENST00000508394	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		38.35	■■■■□ 3.73
SMUG1-215	ENST00000508394	CFTR	P13569	1480 aa		38.26	■■■■□ 3.72
SMUG1-215	ENST00000508394	PRDM2	Q13029	1718 aa		38.08	■■■■□ 3.69
SMUG1-215	ENST00000508394	ERCC6	Q03468	1493 aa		38.07	■■■■□ 3.69
SMUG1-215	ENST00000508394	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		38.06	■■■■□ 3.68
SMUG1-215	ENST00000508394	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		38.05	■■■■□ 3.68
SMUG1-215	ENST00000508394	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		37.98	■■■■□ 3.67
SMUG1-215	ENST00000508394	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		37.87	■■■■□ 3.65
SMUG1-215	ENST00000508394	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	37.71	■■■■□ 3.63
SMUG1-215	ENST00000508394	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		37.67	■■■■□ 3.62
SMUG1-215	ENST00000508394	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	37.57	■■■■□ 3.61
SMUG1-215	ENST00000508394	WDR62	O43379	1518 aa		37.52	■■■■□ 3.6
SMUG1-215	ENST00000508394	ABCC8	Q09428	1581 aa		37.5	■■■■□ 3.59
SMUG1-215	ENST00000508394	TOPBP1	Q92547	1522 aa		37.43	■■■■□ 3.58
SMUG1-215	ENST00000508394	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		37.42	■■■■□ 3.58
SMUG1-215	ENST00000508394	CUX1	P39880	1505 aa		37.4	■■■■□ 3.58
SMUG1-215	ENST00000508394	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	37.35	■■■■□ 3.57
SMUG1-215	ENST00000508394	CUX2	O14529	1486 aa		37.33	■■■■□ 3.57
SMUG1-215	ENST00000508394	SYNJ1	O43426	1573 aa		37.29	■■■■□ 3.56
SMUG1-215	ENST00000508394	TOP2B	Q02880	1626 aa		37.2	■■■■□ 3.55
SMUG1-215	ENST00000508394	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		37.19	■■■■□ 3.54
SMUG1-215	ENST00000508394	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		37.18	■■■■□ 3.54
SMUG1-215	ENST00000508394	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	37.16	■■■■□ 3.54
SMUG1-215	ENST00000508394	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		37.04	■■■■□ 3.52
SMUG1-215	ENST00000508394	IFT140	Q96RY7	1462 aa		37	■■■■□ 3.51
SMUG1-215	ENST00000508394	SOGA1	O94964	1423 aa		37	■■■■□ 3.51
SMUG1-215	ENST00000508394	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	36.98	■■■■□ 3.51
SMUG1-215	ENST00000508394	TRIM41	Q8WV44	630 aa		36.92	■■■■□ 3.5
SMUG1-215	ENST00000508394	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	36.89	■■■■□ 3.5
SMUG1-215	ENST00000508394	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		36.85	■■■■□ 3.49
SMUG1-215	ENST00000508394	WDR97	A6NE52	1622 aa		36.83	■■■■□ 3.49
SMUG1-215	ENST00000508394	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		36.78	■■■■□ 3.48
SMUG1-215	ENST00000508394	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	36.78	■■■■□ 3.48
SMUG1-215	ENST00000508394	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	36.76	■■■■□ 3.47
SMUG1-215	ENST00000508394	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	36.75	■■■■□ 3.47	2e-7	■■■■□ 22.5
SMUG1-215	ENST00000508394	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		36.62	■■■■□ 3.45
SMUG1-215	ENST00000508394	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		36.6	■■■■□ 3.45
SMUG1-215	ENST00000508394	PBRM1	Q86U86	1689 aa		36.54	■■■■□ 3.44
SMUG1-215	ENST00000508394	KIF27	Q86VH2	1401 aa		36.51	■■■■□ 3.43
SMUG1-215	ENST00000508394	GRIN2B	Q13224	1484 aa		36.49	■■■■□ 3.43
SMUG1-215	ENST00000508394	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		36.46	■■■■□ 3.43
SMUG1-215	ENST00000508394	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		36.41	■■■■□ 3.42
SMUG1-215	ENST00000508394	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		36.35	■■■■□ 3.41
SMUG1-215	ENST00000508394	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	36.31	■■■■□ 3.4
SMUG1-215	ENST00000508394	IGF1R	P08069	1367 aa		36.28	■■■■□ 3.4
SMUG1-215	ENST00000508394	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	36.27	■■■■□ 3.4
SMUG1-215	ENST00000508394	FBLN2	P98095	1184 aa		36.26	■■■■□ 3.39
SMUG1-215	ENST00000508394	ADAMTS12	P58397	1594 aa		36.24	■■■■□ 3.39
SMUG1-215	ENST00000508394	CHD1	O14646	1710 aa		36.22	■■■■□ 3.39
SMUG1-215	ENST00000508394	SYNJ2	O15056	1496 aa		36.18	■■■■□ 3.38
SMUG1-215	ENST00000508394	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	36.16	■■■■□ 3.38
SMUG1-215	ENST00000508394	CUL7	Q14999	1698 aa		36.16	■■■■□ 3.38
SMUG1-215	ENST00000508394	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		36.16	■■■■□ 3.38
SMUG1-215	ENST00000508394	EEA1	Q15075	1411 aa		36.13	■■■■□ 3.37
SMUG1-215	ENST00000508394	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		36.1	■■■■□ 3.37
SMUG1-215	ENST00000508394	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		36.07	■■■■□ 3.37
SMUG1-215	ENST00000508394	GRIN2A	Q12879	1464 aa		36.04	■■■■□ 3.36
SMUG1-215	ENST00000508394	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		35.95	■■■■□ 3.35
SMUG1-215	ENST00000508394	PRX	Q9BXM0	1461 aa		35.94	■■■■□ 3.34
SMUG1-215	ENST00000508394	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		35.94	■■■■□ 3.34
SMUG1-215	ENST00000508394	CEP170	Q5SW79	1584 aa		35.87	■■■■□ 3.33
SMUG1-215	ENST00000508394	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		35.86	■■■■□ 3.33
SMUG1-215	ENST00000508394	NUP160	Q12769	1436 aa		35.81	■■■■□ 3.32
SMUG1-215	ENST00000508394	KIF21B	O75037	1637 aa		35.79	■■■■□ 3.32
SMUG1-215	ENST00000508394	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		35.74	■■■■□ 3.31
SMUG1-215	ENST00000508394	GOLGA3	Q08378	1498 aa		35.64	■■■■□ 3.3

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