Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms