Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-204ENST00000394333 444 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.416e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.656e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-206ENST00000479035 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.716e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-211ENST00000584912 2779 ntTSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.146e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-205ENST00000480942 734 ntTSL 211.87□□□□□ -0.515e-56■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.215e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 511.62□□□□□ -0.555e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 59.58□□□□□ -0.885e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 58.63□□□□□ -1.035e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 35.17□□□□□ -1.585e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 22.98□□□□□ -1.935e-12■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRH-203ENST00000486951 687 ntTSL 314.01□□□□□ -0.173e-18■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-18■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.393e-18■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 23.7□□□□□ -1.823e-18■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.01□□□□□ -0.491e-32■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-207ENST00000597646 868 ntTSL 321.91■■□□□ 1.15e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-206ENST00000481386 898 ntTSL 220.84■□□□□ 0.934e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.95e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.875e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-209ENST00000599964 542 ntTSL 420.38■□□□□ 0.855e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.824e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.775e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-204ENST00000468153 940 ntTSL 219.68■□□□□ 0.744e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ISOC2-207ENST00000590921 2283 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.464e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-25■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.294e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.245e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.245e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.25e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 515.27■□□□□ 0.045e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -05e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.044e-13■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.095e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-25■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.175e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.175e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.265e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.345e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.385e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.395e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 SEC13-219ENST00000492602 393 ntTSL 36.13□□□□□ -1.435e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.475e-7■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 318.78■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.453e-8■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-8■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 512.34□□□□□ -0.433e-8■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 411.92□□□□□ -0.53e-8■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 47.77□□□□□ -1.173e-8■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 518.4■□□□□ 0.545e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.015e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.35e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 412.18□□□□□ -0.465e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 517.35■□□□□ 0.374e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.24e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 314.13□□□□□ -0.154e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 314.13□□□□□ -0.154e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 511.61□□□□□ -0.554e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.734e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 210.31□□□□□ -0.764e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-15■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.762e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.462e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 321.91■■□□□ 1.12e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 221.25■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-207ENST00000477306 686 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 39.91□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 39.56□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 210.11□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.89□□□□□ -1.156e-6■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.164e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINH1-208ENST00000526638 719 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.198e-13■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.688e-13■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.589e-17■□□□□ 8.2
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