RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526409.5

AP002990.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene AP002990.1, Length 1,954 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002990.1-201ENST00000526409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.88■■■■■ 4.13
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AP002990.1-201ENST00000526409 NACADO15069 1562 aa33.4■■■□□ 2.94
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AP002990.1-201ENST00000526409 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.26■■■□□ 2.92
AP002990.1-201ENST00000526409 SCRIBQ14160 1630 aa33.04■■■□□ 2.88
AP002990.1-201ENST00000526409 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.74■■■□□ 2.83
AP002990.1-201ENST00000526409 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
AP002990.1-201ENST00000526409 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.38■■■□□ 2.77
AP002990.1-201ENST00000526409 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.93■■■□□ 2.7
AP002990.1-201ENST00000526409 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
AP002990.1-201ENST00000526409 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.66■■■□□ 2.66
AP002990.1-201ENST00000526409 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
AP002990.1-201ENST00000526409 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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AP002990.1-201ENST00000526409 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
AP002990.1-201ENST00000526409 WIZO95785 1651 aa31.41■■■□□ 2.62
AP002990.1-201ENST00000526409 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.12■■■□□ 2.57
AP002990.1-201ENST00000526409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
AP002990.1-201ENST00000526409 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.08■■■□□ 2.57
AP002990.1-201ENST00000526409 SMARCA2P51531 1590 aa31.02■■■□□ 2.56
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AP002990.1-201ENST00000526409 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
AP002990.1-201ENST00000526409 NCAPD3P42695 1498 aa30.86■■■□□ 2.53
AP002990.1-201ENST00000526409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.85■■■□□ 2.53
AP002990.1-201ENST00000526409 HMGXB3Q12766 1538 aa30.78■■■□□ 2.52
AP002990.1-201ENST00000526409 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.68■■■□□ 2.5
AP002990.1-201ENST00000526409 NESP48681 1621 aa30.13■■■□□ 2.41
AP002990.1-201ENST00000526409 CFTRP13569 1480 aa30.09■■■□□ 2.41
AP002990.1-201ENST00000526409 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.07■■■□□ 2.4
AP002990.1-201ENST00000526409 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.07■■■□□ 2.4
AP002990.1-201ENST00000526409 ABCC8Q09428 1581 aa30■■■□□ 2.39
AP002990.1-201ENST00000526409 PRDM2Q13029 1718 aa29.9■■■□□ 2.38
AP002990.1-201ENST00000526409 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.88■■■□□ 2.37
AP002990.1-201ENST00000526409 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.79■■■□□ 2.36
AP002990.1-201ENST00000526409 TRIM41Q8WV44 630 aa29.75■■■□□ 2.35
AP002990.1-201ENST00000526409 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
AP002990.1-201ENST00000526409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.71■■■□□ 2.35
AP002990.1-201ENST00000526409 SYNJ1O43426 1573 aa29.7■■■□□ 2.34
AP002990.1-201ENST00000526409 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.65■■■□□ 2.34
AP002990.1-201ENST00000526409 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.61■■■□□ 2.33
AP002990.1-201ENST00000526409 CUX1P39880 1505 aa29.61■■■□□ 2.33
AP002990.1-201ENST00000526409 TOP2BQ02880 1626 aa29.52■■■□□ 2.32
AP002990.1-201ENST00000526409 ERCC6Q03468 1493 aa29.49■■■□□ 2.31
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AP002990.1-201ENST00000526409 SOGA1O94964 1423 aa29.31■■■□□ 2.28
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AP002990.1-201ENST00000526409 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.11■■■□□ 2.25
AP002990.1-201ENST00000526409 CUX2O14529 1486 aa29.09■■■□□ 2.25
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AP002990.1-201ENST00000526409 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
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AP002990.1-201ENST00000526409 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.71■■■□□ 2.19
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AP002990.1-201ENST00000526409 PRXQ9BXM0 1461 aa28.68■■■□□ 2.18
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AP002990.1-201ENST00000526409 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.62■■■□□ 2.17
AP002990.1-201ENST00000526409 GOLGA3Q08378 1498 aa28.6■■■□□ 2.17
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AP002990.1-201ENST00000526409 CUL7Q14999 1698 aa28.55■■■□□ 2.16
AP002990.1-201ENST00000526409 ADAMTS12P58397 1594 aa28.5■■■□□ 2.15
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AP002990.1-201ENST00000526409 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.44■■■□□ 2.14
AP002990.1-201ENST00000526409 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.41■■■□□ 2.14
AP002990.1-201ENST00000526409 FBLN2P98095 1184 aa28.39■■■□□ 2.14
AP002990.1-201ENST00000526409 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
AP002990.1-201ENST00000526409 CEP162Q5TB80 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
AP002990.1-201ENST00000526409 SYNJ2O15056 1496 aa28.31■■■□□ 2.12
AP002990.1-201ENST00000526409 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
AP002990.1-201ENST00000526409 GRIN2AQ12879 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
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