Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO2P25791 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO2P25791 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO2P25791 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO2P25791 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO2P25791 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO2P25791 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO2P25791 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO2P25791 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO2P25791 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO2P25791 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO2P25791 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO2P25791 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO2P25791 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO2P25791 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO2P25791 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO2P25791 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms