Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL1RAPQ9NPH3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IL1RAPQ9NPH3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IL1RAPQ9NPH3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms