Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFDN5Q99471 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFDN5Q99471 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms