RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.53■■■■■ 4.08
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ZNF554-201ENST00000317243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.1■■■■□ 3.05
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ZNF554-201ENST00000317243 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.58■■■□□ 2.81
ZNF554-201ENST00000317243 SCRIBQ14160 1630 aa32.57■■■□□ 2.81
ZNF554-201ENST00000317243 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.51■■■□□ 2.8
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ZNF554-201ENST00000317243 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.74■■■□□ 2.67
ZNF554-201ENST00000317243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.74■■■□□ 2.67
ZNF554-201ENST00000317243 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.64■■■□□ 2.66
ZNF554-201ENST00000317243 WIZO95785 1651 aa31.48■■■□□ 2.63
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ZNF554-201ENST00000317243 TRIM41Q8WV44 630 aa31.37■■■□□ 2.61
ZNF554-201ENST00000317243 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.32■■■□□ 2.6
ZNF554-201ENST00000317243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.28■■■□□ 2.6
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ZNF554-201ENST00000317243 SMARCA4P51532 1647 aa30.96■■■□□ 2.55
ZNF554-201ENST00000317243 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.87■■■□□ 2.53
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ZNF554-201ENST00000317243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.78■■■□□ 2.52
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ZNF554-201ENST00000317243 ABCC8Q09428 1581 aa30.73■■■□□ 2.51
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ZNF554-201ENST00000317243 SOGA1O94964 1423 aa30.35■■■□□ 2.45
ZNF554-201ENST00000317243 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
ZNF554-201ENST00000317243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.29■■■□□ 2.44
ZNF554-201ENST00000317243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.26■■■□□ 2.43
ZNF554-201ENST00000317243 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.23■■■□□ 2.43
ZNF554-201ENST00000317243 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
ZNF554-201ENST00000317243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ZNF554-201ENST00000317243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
ZNF554-201ENST00000317243 SYNJ1O43426 1573 aa30.02■■■□□ 2.4
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ZNF554-201ENST00000317243 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
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ZNF554-201ENST00000317243 NEUROD1Q13562 356 aa29.79■■■□□ 2.36
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ZNF554-201ENST00000317243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.59■■■□□ 2.17
ZNF554-201ENST00000317243 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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