Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C2P49116 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2C2P49116 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms