Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms