Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD3Q9UJU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms