Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKBIBQ15653 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
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