RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295612.7

EIF4E3-201, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EIF4E3, Length 2,764 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4E3-201ENST00000295612 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.7■■■■□ 3.79
EIF4E3-201ENST00000295612 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.96■■■□□ 2.87
EIF4E3-201ENST00000295612 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
EIF4E3-201ENST00000295612 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.6■■■□□ 2.81
EIF4E3-201ENST00000295612 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
EIF4E3-201ENST00000295612 HRCP23327 699 aa32.48■■■□□ 2.79
EIF4E3-201ENST00000295612 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
EIF4E3-201ENST00000295612 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
EIF4E3-201ENST00000295612 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.07■■■□□ 2.72
EIF4E3-201ENST00000295612 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.82■■■□□ 2.68
EIF4E3-201ENST00000295612 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.6■■■□□ 2.65
EIF4E3-201ENST00000295612 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.54■■■□□ 2.64
EIF4E3-201ENST00000295612 ABCC9O60706 1549 aa31.3■■■□□ 2.6
EIF4E3-201ENST00000295612 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.08■■■□□ 2.57
EIF4E3-201ENST00000295612 SCRIBQ14160 1630 aa31.05■■■□□ 2.56
EIF4E3-201ENST00000295612 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
EIF4E3-201ENST00000295612 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
EIF4E3-201ENST00000295612 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
EIF4E3-201ENST00000295612 NACADO15069 1562 aa30.67■■■□□ 2.5
EIF4E3-201ENST00000295612 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
EIF4E3-201ENST00000295612 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.36■■■□□ 2.45
EIF4E3-201ENST00000295612 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.31■■■□□ 2.44
EIF4E3-201ENST00000295612 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
EIF4E3-201ENST00000295612 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.14■■■□□ 2.42
EIF4E3-201ENST00000295612 NEUROD1Q13562 356 aa30.08■■■□□ 2.41
EIF4E3-201ENST00000295612 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.07■■■□□ 2.4
EIF4E3-201ENST00000295612 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
EIF4E3-201ENST00000295612 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
EIF4E3-201ENST00000295612 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
EIF4E3-201ENST00000295612 WIZO95785 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
EIF4E3-201ENST00000295612 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.9■■■□□ 2.38
EIF4E3-201ENST00000295612 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.88■■■□□ 2.37
EIF4E3-201ENST00000295612 TRIM41Q8WV44 630 aa29.8■■■□□ 2.36
EIF4E3-201ENST00000295612 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
EIF4E3-201ENST00000295612 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
EIF4E3-201ENST00000295612 MYT1Q01538 1121 aa29.64■■■□□ 2.33
EIF4E3-201ENST00000295612 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.57■■■□□ 2.32
EIF4E3-201ENST00000295612 SMARCA4P51532 1647 aa29.55■■■□□ 2.32
EIF4E3-201ENST00000295612 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
EIF4E3-201ENST00000295612 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
EIF4E3-201ENST00000295612 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
EIF4E3-201ENST00000295612 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
EIF4E3-201ENST00000295612 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.34■■■□□ 2.29
EIF4E3-201ENST00000295612 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
EIF4E3-201ENST00000295612 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
EIF4E3-201ENST00000295612 SMARCA2P51531 1590 aa29.23■■■□□ 2.27
EIF4E3-201ENST00000295612 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
EIF4E3-201ENST00000295612 ABCC8Q09428 1581 aa29.15■■■□□ 2.26
EIF4E3-201ENST00000295612 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.98■■■□□ 2.23
EIF4E3-201ENST00000295612 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.92■■■□□ 2.22
EIF4E3-201ENST00000295612 MIER1Q8N108 512 aa28.87■■■□□ 2.21
EIF4E3-201ENST00000295612 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
EIF4E3-201ENST00000295612 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
EIF4E3-201ENST00000295612 SOGA1O94964 1423 aa28.8■■■□□ 2.2
EIF4E3-201ENST00000295612 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.72■■■□□ 2.19
EIF4E3-201ENST00000295612 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
EIF4E3-201ENST00000295612 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.57■■■□□ 2.16
EIF4E3-201ENST00000295612 SYNJ1O43426 1573 aa28.52■■■□□ 2.16
EIF4E3-201ENST00000295612 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
EIF4E3-201ENST00000295612 NCAPD3P42695 1498 aa28.46■■■□□ 2.15
EIF4E3-201ENST00000295612 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
EIF4E3-201ENST00000295612 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
EIF4E3-201ENST00000295612 CEP162Q5TB80 1403 aa28.35■■■□□ 2.13
EIF4E3-201ENST00000295612 HMGXB3Q12766 1538 aa28.33■■■□□ 2.13
EIF4E3-201ENST00000295612 EEA1Q15075 1411 aa28.32■■■□□ 2.12
EIF4E3-201ENST00000295612 BCL11AQ9H165 835 aa28.29■■■□□ 2.12
EIF4E3-201ENST00000295612 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.29■■■□□ 2.12
EIF4E3-201ENST00000295612 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.26■■■□□ 2.11
EIF4E3-201ENST00000295612 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
EIF4E3-201ENST00000295612 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.22■■■□□ 2.11
EIF4E3-201ENST00000295612 GOLGA3Q08378 1498 aa28.2■■■□□ 2.1
EIF4E3-201ENST00000295612 TOP2BQ02880 1626 aa28.14■■■□□ 2.09
EIF4E3-201ENST00000295612 CFTRP13569 1480 aa28.11■■■□□ 2.09
EIF4E3-201ENST00000295612 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.08■■■□□ 2.09
EIF4E3-201ENST00000295612 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
EIF4E3-201ENST00000295612 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.07■■■□□ 2.08
EIF4E3-201ENST00000295612 CUX1P39880 1505 aa28.07■■■□□ 2.08
EIF4E3-201ENST00000295612 BCANQ96GW7 911 aa28.04■■■□□ 2.08
EIF4E3-201ENST00000295612 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.99■■■□□ 2.07
EIF4E3-201ENST00000295612 KIF21BO75037 1637 aa27.97■■■□□ 2.07
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EIF4E3-201ENST00000295612 CLIP1P30622 1438 aa27.93■■■□□ 2.06
EIF4E3-201ENST00000295612 KCNH8Q96L42 1107 aa27.91■■■□□ 2.06
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EIF4E3-201ENST00000295612 NESP48681 1621 aa27.75■■■□□ 2.03
EIF4E3-201ENST00000295612 FKBP8Q14318 412 aa27.69■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.69■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 CUX2O14529 1486 aa27.69■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 PRDM2Q13029 1718 aa27.67■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.67■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.65■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 APLP2Q06481 763 aa27.65■■■□□ 2.02
EIF4E3-201ENST00000295612 IGF1RP08069 1367 aa27.61■■■□□ 2.01
EIF4E3-201ENST00000295612 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.61■■■□□ 2.01
EIF4E3-201ENST00000295612 ITGAEP38570 1179 aa27.6■■■□□ 2.01
EIF4E3-201ENST00000295612 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
EIF4E3-201ENST00000295612 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
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