Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP20Q9Y6A4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP20Q9Y6A4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP20Q9Y6A4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP20Q9Y6A4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP20Q9Y6A4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP20Q9Y6A4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP20Q9Y6A4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms