Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC42Q9Y546 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC42Q9Y546 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC42Q9Y546 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC42Q9Y546 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC42Q9Y546 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC42Q9Y546 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC42Q9Y546 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC42Q9Y546 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms