Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y316

MEMO1, Protein MEMO1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEMO1Q9Y316 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEMO1Q9Y316 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEMO1Q9Y316 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEMO1Q9Y316 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEMO1Q9Y316 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEMO1Q9Y316 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEMO1Q9Y316 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEMO1Q9Y316 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms