Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRAPPC8Q9Y2L5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRAPPC8Q9Y2L5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms