Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HPS5Q9UPZ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HPS5Q9UPZ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
HPS5Q9UPZ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HPS5Q9UPZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HPS5Q9UPZ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS5Q9UPZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HPS5Q9UPZ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HPS5Q9UPZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HPS5Q9UPZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HPS5Q9UPZ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HPS5Q9UPZ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HPS5Q9UPZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HPS5Q9UPZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HPS5Q9UPZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms