Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACSL6Q9UKU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACSL6Q9UKU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACSL6Q9UKU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSL6Q9UKU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACSL6Q9UKU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL6Q9UKU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL6Q9UKU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL6Q9UKU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms