Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF221Q9UK13 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF221Q9UK13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF221Q9UK13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF221Q9UK13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF221Q9UK13 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF221Q9UK13 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF221Q9UK13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF221Q9UK13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF221Q9UK13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms