Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN2Q9UHD9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN2Q9UHD9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBQLN2Q9UHD9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBQLN2Q9UHD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBQLN2Q9UHD9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms