Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD3Q9UBI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD3Q9UBI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD3Q9UBI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD3Q9UBI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD3Q9UBI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD3Q9UBI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD3Q9UBI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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