Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N6

KANSL3, KAT8 regulatory NSL complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANSL3Q9P2N6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KANSL3Q9P2N6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KANSL3Q9P2N6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KANSL3Q9P2N6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KANSL3Q9P2N6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KANSL3Q9P2N6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KANSL3Q9P2N6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KANSL3Q9P2N6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KANSL3Q9P2N6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KANSL3Q9P2N6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms