Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP53Q9NZM5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
NOP53Q9NZM5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP53Q9NZM5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP53Q9NZM5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP53Q9NZM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP53Q9NZM5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms