Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXCQ9NY87 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXCQ9NY87 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXCQ9NY87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXCQ9NY87 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXCQ9NY87 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms