Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF7

DCAF16, DDB1- and CUL4-associated factor 16, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF16Q9NXF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms