Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COMMD8Q9NX08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COMMD8Q9NX08 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COMMD8Q9NX08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COMMD8Q9NX08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMMD8Q9NX08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMMD8Q9NX08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMMD8Q9NX08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COMMD8Q9NX08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMMD8Q9NX08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COMMD8Q9NX08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COMMD8Q9NX08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COMMD8Q9NX08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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