Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CEP83-213ENST00000551596 631 ntTSL 33.05□□□□□ -1.922e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-208ENST00000561726 543 ntTSL 42.76□□□□□ -1.972e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.992e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-214ENST00000568806 298 ntTSL 51.91□□□□□ -2.12e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-13■■■■■ 59.6
RBM22Q9NW64 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-13■■■■■ 59.6
RBM22Q9NW64 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 59.6
RBM22Q9NW64 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 59.6
RBM22Q9NW64 TTC17-208ENST00000526774 3360 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.512e-10■■■■■ 59.6
RBM22Q9NW64 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 416.5■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 59.5
RBM22Q9NW64 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 58.7
RBM22Q9NW64 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 58.7
RBM22Q9NW64 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.22□□□□□ -2.053e-7■■■■■ 58.7
RBM22Q9NW64 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 21.5□□□□□ -2.173e-7■■■■■ 58.7
RBM22Q9NW64 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.233e-7■■■■■ 58.7
RBM22Q9NW64 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-10■■■■■ 58.4
RBM22Q9NW64 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 58.4
RBM22Q9NW64 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.414e-11■■■■■ 58.3
RBM22Q9NW64 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.894e-11■■■■■ 58.3
RBM22Q9NW64 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 24.92□□□□□ -1.624e-11■■■■■ 58.3
RBM22Q9NW64 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 421.3■■□□□ 11e-11■■■■■ 58.1
RBM22Q9NW64 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 414.97□□□□□ -0.011e-11■■■■■ 58.1
RBM22Q9NW64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.896e-14■■■■■ 58
RBM22Q9NW64 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-14■■■■■ 58
RBM22Q9NW64 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-25■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 215.9■□□□□ 0.145e-25■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 515.67■□□□□ 0.13e-25■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-224ENST00000463098 869 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-24■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-24■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 37.77□□□□□ -1.175e-25■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-238ENST00000493853 567 ntTSL 47.51□□□□□ -1.211e-24■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-25■■■■■ 57.8
RBM22Q9NW64 MSH5-SAPCD1-206ENST00000491552 706 ntTSL 316.44■□□□□ 0.222e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.182e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 314.79□□□□□ -0.042e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 514.27□□□□□ -0.132e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.36□□□□□ -0.752e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-13■■■■■ 57.4
RBM22Q9NW64 TXNIP-203ENST00000488537 1509 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-10■■■■■ 57.2
RBM22Q9NW64 A2M-212ENST00000545828 471 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-19■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 24.71□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.071e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-226ENST00000631619 2457 ntTSL 517.99■□□□□ 0.471e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-217ENST00000476367 1603 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-212ENST00000470121 1889 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-219ENST00000477127 1464 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 CCNL1-216ENST00000475298 2362 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 ROCK2-208ENST00000493096 461 ntTSL 20.4□□□□□ -2.351e-10■■■■■ 57
RBM22Q9NW64 TRMU-210ENST00000470831 1860 ntTSL 216.65■□□□□ 0.263e-23■■■■■ 56.7
RBM22Q9NW64 TRMU-216ENST00000491612 2933 ntTSL 214.72□□□□□ -0.053e-23■■■■■ 56.7
RBM22Q9NW64 TRMU-214ENST00000485559 2653 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-23■■■■■ 56.7
RBM22Q9NW64 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.877e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 317.67■□□□□ 0.427e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.257e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.79□□□□□ -1.327e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 25.89□□□□□ -1.477e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-208ENST00000483643 690 ntTSL 25.89□□□□□ -1.477e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 NAP1L4-214ENST00000528261 644 ntTSL 23.42□□□□□ -1.867e-10■■■■■ 56.4
RBM22Q9NW64 FDFT1-216ENST00000529521 418 ntTSL 22.28□□□□□ -2.042e-9■■■■■ 56.3
RBM22Q9NW64 RAN-208ENST00000537745 1065 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.772e-13■■■■■ 56.2
RBM22Q9NW64 A2M-211ENST00000543436 600 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-12■■■■■ 56.1
RBM22Q9NW64 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-12■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-12■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.245e-12■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 HMGXB3-205ENST00000514469 975 ntTSL 510.45□□□□□ -0.745e-12■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 416.21■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-212ENST00000599980 750 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 411.68□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 47.89□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.212e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.32e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 55.7
RBM22Q9NW64 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 55.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-205ENST00000534976 3165 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-10■■■■■ 55.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 55.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-10■■■■■ 55.5
RBM22Q9NW64 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 55.4
RBM22Q9NW64 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 54.5
RBM22Q9NW64 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 54.5
RBM22Q9NW64 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 54.5
RBM22Q9NW64 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.38□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 54.5
RBM22Q9NW64 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 54.5
RBM22Q9NW64 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 54.4
RBM22Q9NW64 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 54.2
RBM22Q9NW64 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 54.1
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 65.4 ms