Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRMQ9NS64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRMQ9NS64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRMQ9NS64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRMQ9NS64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRMQ9NS64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPRMQ9NS64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms