Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAPOLBQ9NRJ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLBQ9NRJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPOLBQ9NRJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLBQ9NRJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms