Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TSHZ2Q9NRE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TSHZ2Q9NRE2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TSHZ2Q9NRE2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TSHZ2Q9NRE2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TSHZ2Q9NRE2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TSHZ2Q9NRE2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TSHZ2Q9NRE2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TSHZ2Q9NRE2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TSHZ2Q9NRE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSHZ2Q9NRE2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TSHZ2Q9NRE2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSHZ2Q9NRE2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TSHZ2Q9NRE2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSHZ2Q9NRE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TSHZ2Q9NRE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSHZ2Q9NRE2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSHZ2Q9NRE2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSHZ2Q9NRE2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms