Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
MYO5CQ9NQX4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
MYO5CQ9NQX4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
MYO5CQ9NQX4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
MYO5CQ9NQX4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
MYO5CQ9NQX4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
MYO5CQ9NQX4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYO5CQ9NQX4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MYO5CQ9NQX4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
MYO5CQ9NQX4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
MYO5CQ9NQX4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MYO5CQ9NQX4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
MYO5CQ9NQX4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MYO5CQ9NQX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MYO5CQ9NQX4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
MYO5CQ9NQX4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYO5CQ9NQX4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MYO5CQ9NQX4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MYO5CQ9NQX4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
MYO5CQ9NQX4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.93■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
MYO5CQ9NQX4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
MYO5CQ9NQX4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
MYO5CQ9NQX4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
MYO5CQ9NQX4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms