Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCB6Q9NP58 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCB6Q9NP58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB6Q9NP58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCB6Q9NP58 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCB6Q9NP58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB6Q9NP58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB6Q9NP58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB6Q9NP58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCB6Q9NP58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB6Q9NP58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB6Q9NP58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB6Q9NP58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCB6Q9NP58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB6Q9NP58 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCB6Q9NP58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCB6Q9NP58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms