Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POPDC2Q9HBU9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POPDC2Q9HBU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POPDC2Q9HBU9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POPDC2Q9HBU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POPDC2Q9HBU9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POPDC2Q9HBU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POPDC2Q9HBU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POPDC2Q9HBU9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms