Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
RAB3GAP2Q9H2M9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms