Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SCAPERQ9BY12 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SCAPERQ9BY12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SCAPERQ9BY12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SCAPERQ9BY12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SCAPERQ9BY12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SCAPERQ9BY12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SCAPERQ9BY12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SCAPERQ9BY12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SCAPERQ9BY12 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
SCAPERQ9BY12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
SCAPERQ9BY12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
SCAPERQ9BY12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SCAPERQ9BY12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SCAPERQ9BY12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SCAPERQ9BY12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SCAPERQ9BY12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SCAPERQ9BY12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SCAPERQ9BY12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SCAPERQ9BY12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SCAPERQ9BY12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SCAPERQ9BY12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
SCAPERQ9BY12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SCAPERQ9BY12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
SCAPERQ9BY12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SCAPERQ9BY12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SCAPERQ9BY12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SCAPERQ9BY12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SCAPERQ9BY12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
SCAPERQ9BY12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
SCAPERQ9BY12 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms