Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBDC1Q9BVG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PBDC1Q9BVG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBDC1Q9BVG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms