Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOCK3Q9BQ16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCK3Q9BQ16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCK3Q9BQ16 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPOCK3Q9BQ16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK3Q9BQ16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCK3Q9BQ16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK3Q9BQ16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK3Q9BQ16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK3Q9BQ16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK3Q9BQ16 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK3Q9BQ16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK3Q9BQ16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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