Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMF1Q96S06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMF1Q96S06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMF1Q96S06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMF1Q96S06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMF1Q96S06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMF1Q96S06 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMF1Q96S06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms