Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITED4Q96RK1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITED4Q96RK1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITED4Q96RK1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CITED4Q96RK1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CITED4Q96RK1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms