Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01600Q96MT4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01600Q96MT4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01600Q96MT4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01600Q96MT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms