Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCARF2Q96GP6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF2Q96GP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF2Q96GP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF2Q96GP6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF2Q96GP6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCARF2Q96GP6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF2Q96GP6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF2Q96GP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF2Q96GP6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms