Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDN23Q96B33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDN23Q96B33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN23Q96B33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN23Q96B33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLDN23Q96B33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLDN23Q96B33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN23Q96B33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN23Q96B33 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN23Q96B33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms