Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKD2Q969F2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NKD2Q969F2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKD2Q969F2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKD2Q969F2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NKD2Q969F2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NKD2Q969F2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKD2Q969F2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms