Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A3Q93084 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A3Q93084 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A3Q93084 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A3Q93084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2A3Q93084 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A3Q93084 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A3Q93084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A3Q93084 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms