Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED12Q93074 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED12Q93074 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED12Q93074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED12Q93074 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED12Q93074 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED12Q93074 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED12Q93074 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED12Q93074 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED12Q93074 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED12Q93074 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MED12Q93074 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED12Q93074 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED12Q93074 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED12Q93074 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED12Q93074 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED12Q93074 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED12Q93074 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED12Q93074 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED12Q93074 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED12Q93074 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED12Q93074 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED12Q93074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MED12Q93074 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED12Q93074 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED12Q93074 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED12Q93074 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED12Q93074 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED12Q93074 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED12Q93074 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED12Q93074 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED12Q93074 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED12Q93074 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED12Q93074 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED12Q93074 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED12Q93074 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED12Q93074 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED12Q93074 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED12Q93074 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED12Q93074 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED12Q93074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED12Q93074 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED12Q93074 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED12Q93074 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED12Q93074 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED12Q93074 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED12Q93074 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED12Q93074 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED12Q93074 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED12Q93074 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MED12Q93074 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED12Q93074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED12Q93074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED12Q93074 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED12Q93074 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED12Q93074 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED12Q93074 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED12Q93074 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MED12Q93074 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED12Q93074 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED12Q93074 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED12Q93074 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED12Q93074 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED12Q93074 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED12Q93074 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED12Q93074 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED12Q93074 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED12Q93074 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED12Q93074 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED12Q93074 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED12Q93074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED12Q93074 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED12Q93074 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED12Q93074 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED12Q93074 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED12Q93074 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED12Q93074 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED12Q93074 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED12Q93074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED12Q93074 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MED12Q93074 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED12Q93074 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED12Q93074 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED12Q93074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED12Q93074 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED12Q93074 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED12Q93074 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED12Q93074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED12Q93074 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED12Q93074 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED12Q93074 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED12Q93074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED12Q93074 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED12Q93074 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED12Q93074 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms