Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA4DQ92854 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SEMA4DQ92854 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA4DQ92854 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA4DQ92854 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4DQ92854 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4DQ92854 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA4DQ92854 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA4DQ92854 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms